Det oplyser ISS i en pressemeddelelse.
Han overtager efter Carlsbergs nuværende topchef, Cees 't Hart, der i begyndelsen af marts meddelte, at han trækker sig tilbage og forlader sin post hos bryggerikoncernen.
Hollænderen, der har siddet i direktørstolen i otte år, stopper senest med udgangen af tredje kvartal.
Men det vides ikke, hvornår Jacob Aarup-Andersen officielt overtager jobbet.
Hans startdato vil ifølge Carlsberg blive annonceret senere, oplyser koncernen i en pressemeddelelse.
Jacob Aarup-Andersen har været en del af ISS siden 2020.